Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn12Q9ET43 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Cldn12Q9ET43 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn12Q9ET43 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn12Q9ET43 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms