Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESB3

Hrg, Histidine-rich glycoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrgQ9ESB3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
HrgQ9ESB3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HrgQ9ESB3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HrgQ9ESB3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HrgQ9ESB3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrgQ9ESB3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HrgQ9ESB3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms