Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH7

Hipk3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hipk3Q9ERH7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Hipk3Q9ERH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Hipk3Q9ERH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Hipk3Q9ERH7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Hipk3Q9ERH7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms