Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ndst3Q9EQH7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ndst3Q9EQH7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ndst3Q9EQH7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndst3Q9EQH7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndst3Q9EQH7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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