Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQG9

Col4a3bp, Collagen type IV alpha-3-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3bpQ9EQG9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Col4a3bpQ9EQG9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Col4a3bpQ9EQG9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Col4a3bpQ9EQG9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Col4a3bpQ9EQG9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Col4a3bpQ9EQG9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Col4a3bpQ9EQG9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms