Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Rpgrip1Q9EPQ2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Rpgrip1Q9EPQ2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC35.26■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Rpgrip1Q9EPQ2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Rpgrip1Q9EPQ2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms