Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gpr88Q9EPB7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gpr88Q9EPB7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gpr88Q9EPB7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gpr88Q9EPB7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gpr88Q9EPB7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms