Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP53

Tsc1, Hamartin, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc1Q9EP53 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tsc1Q9EP53 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tsc1Q9EP53 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tsc1Q9EP53 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tsc1Q9EP53 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms