Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trmt112Q9DCG9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trmt112Q9DCG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trmt112Q9DCG9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Trmt112Q9DCG9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trmt112Q9DCG9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trmt112Q9DCG9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trmt112Q9DCG9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trmt112Q9DCG9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trmt112Q9DCG9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms