Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,85■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19,84■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,84■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19,84■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,77
Cmtm2aQ9DAR1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,81■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19,8■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19,79■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
Cmtm2aQ9DAR1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,75■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,74■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,73■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19,72■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,71■□□□□ 0,75
Cmtm2aQ9DAR1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,7■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19,69■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,68■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19,68■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19,68■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19,67■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,66■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Cmtm2aQ9DAR1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,66■□□□□ 0,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms