Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL3

Ccdc54, Coiled-coil domain-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc54Q9DAL3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc54Q9DAL3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccdc54Q9DAL3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Ccdc54Q9DAL3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc54Q9DAL3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms