Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rsph3bQ9DA80 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rsph3bQ9DA80 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rsph3bQ9DA80 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rsph3bQ9DA80 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rsph3bQ9DA80 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rsph3bQ9DA80 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms