Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc89Q9DA73 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc89Q9DA73 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc89Q9DA73 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc89Q9DA73 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc89Q9DA73 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc89Q9DA73 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.4 ms