Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cntd1Q9D995 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cntd1Q9D995 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cntd1Q9D995 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cntd1Q9D995 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms