Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Tvp23bQ9D8T4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tvp23bQ9D8T4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Tvp23bQ9D8T4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Tvp23bQ9D8T4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.4 ms