Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gtf3c6Q9D8P7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gtf3c6Q9D8P7 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gtf3c6Q9D8P7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms