Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D727 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D727 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D727 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D727 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D727 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D727 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D727 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D727 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D727 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D727 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D727 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D727 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D727 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D727 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9D727 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9D727 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D727 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D727 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9D727 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9D727 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D727 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D727 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D727 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D727 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D727 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D727 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D727 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D727 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D727 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D727 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D727 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D727 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9D727 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms