Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MsraQ9D6Y7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MsraQ9D6Y7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MsraQ9D6Y7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MsraQ9D6Y7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MsraQ9D6Y7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MsraQ9D6Y7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MsraQ9D6Y7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MsraQ9D6Y7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MsraQ9D6Y7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms