Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cmtm5Q9D6G9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cmtm5Q9D6G9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cmtm5Q9D6G9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cmtm5Q9D6G9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cmtm5Q9D6G9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms