Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tubb4aQ9D6F9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tubb4aQ9D6F9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tubb4aQ9D6F9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tubb4aQ9D6F9 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tubb4aQ9D6F9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms