Protein–RNA interactions for Protein: Q9D665

Sdr42e1, Short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr42e1Q9D665 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Sdr42e1Q9D665 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Sdr42e1Q9D665 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sdr42e1Q9D665 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sdr42e1Q9D665 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Sdr42e1Q9D665 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms