Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lpcat2bQ9D5U0 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lpcat2bQ9D5U0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lpcat2bQ9D5U0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lpcat2bQ9D5U0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms