Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Speer4f1Q9D5Q6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Speer4f1Q9D5Q6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Speer4f1Q9D5Q6 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Speer4f1Q9D5Q6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Speer4f1Q9D5Q6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms