Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc7Q9D541 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc7Q9D541 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc7Q9D541 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc7Q9D541 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
Ccdc7Q9D541 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc7Q9D541 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms