Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ccdc83Q9D4V3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc83Q9D4V3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc83Q9D4V3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccdc83Q9D4V3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms