Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U7

4930556J24Rik, RIKEN cDNA 4930556J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930556J24RikQ9D4U7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
4930556J24RikQ9D4U7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930556J24RikQ9D4U7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930556J24RikQ9D4U7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.6 ms