Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2al3Q9D4U4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2al3Q9D4U4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2al3Q9D4U4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms