Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
4930548H24RikQ9D496 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930548H24RikQ9D496 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930548H24RikQ9D496 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
4930548H24RikQ9D496 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms