Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syce1Q9D495 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syce1Q9D495 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Syce1Q9D495 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syce1Q9D495 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms