Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
4933425L06RikQ9D3Z8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms