Protein–RNA interactions for Protein: Q9D308

9030624G23Rik, RIKEN cDNA 9030624G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030624G23RikQ9D308 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
9030624G23RikQ9D308 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9030624G23RikQ9D308 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
9030624G23RikQ9D308 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
9030624G23RikQ9D308 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms