Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Trappc6bQ9D289 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Trappc6bQ9D289 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trappc6bQ9D289 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc6bQ9D289 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms