Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Nol3Q9D1X0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Nol3Q9D1X0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nol3Q9D1X0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nol3Q9D1X0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms