Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1I5

Mcee, Methylmalonyl-CoA epimerase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MceeQ9D1I5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MceeQ9D1I5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MceeQ9D1I5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MceeQ9D1I5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MceeQ9D1I5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
MceeQ9D1I5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms