Protein–RNA interactions for Protein: Q9D103

Ifitm1, Interferon-induced transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifitm1Q9D103 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifitm1Q9D103 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Ifitm1Q9D103 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ifitm1Q9D103 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ifitm1Q9D103 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifitm1Q9D103 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ifitm1Q9D103 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifitm1Q9D103 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifitm1Q9D103 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms