Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M2

Cdca7, Cell division cycle-associated protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca7Q9D0M2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cdca7Q9D0M2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cdca7Q9D0M2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cdca7Q9D0M2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Cdca7Q9D0M2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cdca7Q9D0M2 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cdca7Q9D0M2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms