Protein–RNA interactions for Protein: Q9D067

Mdm1, Nuclear protein MDM1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm1Q9D067 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Mdm1Q9D067 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mdm1Q9D067 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mdm1Q9D067 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mdm1Q9D067 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mdm1Q9D067 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Mdm1Q9D067 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms