Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc47Q9D024 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc47Q9D024 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc47Q9D024 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc47Q9D024 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
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