Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Shisa9Q9CZN4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shisa9Q9CZN4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Shisa9Q9CZN4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms