Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Mrpl55Q9CZ83 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mrpl55Q9CZ83 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl55Q9CZ83 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl55Q9CZ83 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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