Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ70

3110001I22Rik, MCG129801, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110001I22RikQ9CZ70 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110001I22RikQ9CZ70 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110001I22RikQ9CZ70 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110001I22RikQ9CZ70 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
3110001I22RikQ9CZ70 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
3110001I22RikQ9CZ70 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
3110001I22RikQ9CZ70 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
3110001I22RikQ9CZ70 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms