Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ61

Gm17509, Predicted gene, 17509, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17509Q9CZ61 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC16,24■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,23■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16,22■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16,21■□□□□ 0,19
Gm17509Q9CZ61 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC16,2■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,19■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16,18■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16,17■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,16■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,18
Gm17509Q9CZ61 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16,13■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16,11■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
Gm17509Q9CZ61 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm17509Q9CZ61 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16,08■□□□□ 0,16
Gm17509Q9CZ61 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm17509Q9CZ61 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm17509Q9CZ61 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Gm17509Q9CZ61 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15,3 ms