Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Q9CYI0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9CYI0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9CYI0 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Q9CYI0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Q9CYI0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Q9CYI0 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Q9CYI0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Q9CYI0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Q9CYI0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms