Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Exo5Q9CXP9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Exo5Q9CXP9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Exo5Q9CXP9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Exo5Q9CXP9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 144.9 ms