Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV0

Malsu1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Malsu1Q9CWV0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Malsu1Q9CWV0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Malsu1Q9CWV0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Malsu1Q9CWV0 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms