Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tdrd12Q9CWU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tdrd12Q9CWU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tdrd12Q9CWU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms