Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnot11Q9CWN7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cnot11Q9CWN7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cnot11Q9CWN7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cnot11Q9CWN7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cnot11Q9CWN7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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