Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CRC3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRC3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRC3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRC3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CRC3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CRC3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRC3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q9CRC3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms