Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ska2Q9CR46 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ska2Q9CR46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ska2Q9CR46 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska2Q9CR46 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska2Q9CR46 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ska2Q9CR46 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ska2Q9CR46 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ska2Q9CR46 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ska2Q9CR46 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms