Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SdhbQ9CQA3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SdhbQ9CQA3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SdhbQ9CQA3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SdhbQ9CQA3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SdhbQ9CQA3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms